Фраза "Внутрішні шари" або "внутрішній шар" більш точно описують структури, що страждають при язві, оскільки язва може охоплювати не лише слизову оболонку, а й м'язовий шар.

Можна використовувати русизм - вистілка. Словник пропонує, але слово є менш розповсюдженим.