Glossary entry (derived from question below)
English term or phrase:
Smallest sum probability [BLAST algorithm]
Italian translation:
Minima probabilitá sommata (secondo Karlin-Altshul)
Added to glossary by
Alberto Manni
Mar 20, 2012 15:06
12 yrs ago
4 viewers *
English term
Smallest sum probability
English to Italian
Other
Mathematics & Statistics
Analisi statistica
One measure of similarity provided by the BLAST algorithm is the smallest sum probability (P(N)).
Forse mi sto perdendo in un bicchiere d'acqua, ma non riesco a venirne a capo.
Grazie per l'aiuto!
Forse mi sto perdendo in un bicchiere d'acqua, ma non riesco a venirne a capo.
Grazie per l'aiuto!
Proposed translations
(Italian)
4 | minima probabilitá sommata (secondo Karlin-Altshul) |
Alberto Manni
![]() |
4 | la minima probabilità sommaria (sommativa/cumulativa§totale)) |
Rossinka
![]() |
References
qui spiega cos'è |
Danila Moro
![]() |
Change log
Mar 27, 2012 12:22: Alberto Manni Created KOG entry
Proposed translations
3 hrs
Selected
minima probabilitá sommata (secondo Karlin-Altshul)
Si parla di un calcolo di probabilitá con un metodo di somma pesata, ideato da Karlin e Altshul, che non è una semplice somma aritmetica.
"The P-values are a function of N, as used in Karlin-Altschul "Sum" statistics or Poisson statistics, to treat situations where multiple HSPs
are found."
"The P-values are a function of N, as used in Karlin-Altschul "Sum" statistics or Poisson statistics, to treat situations where multiple HSPs
are found."
Reference:
4 KudoZ points awarded for this answer.
Comment: "Grazie a tutti per l'aiuto!"
54 mins
la minima probabilità sommaria (sommativa/cumulativa§totale))
http://www-fog.bio.unipd.it/bioinfor/blast.html
Valutazione statistica dei risultati
Il punteggio degli HSP gode della proprietà di poter essere analizzato statisticamente (Karlin & Altschul, 1990) [3]
A questo scopo viene utilizzata la distribuzione di Poisson. Nell'output di BLAST compare infatti un valore P(N) che rappresenta la probabilità che il punteggio di tali HSP definisca una similarità casuale. Tanto più piccolo è questo valore, tanto maggiore è la probabilità che non si tratti di pura casualità.
Valutazione statistica dei risultati
Il punteggio degli HSP gode della proprietà di poter essere analizzato statisticamente (Karlin & Altschul, 1990) [3]
A questo scopo viene utilizzata la distribuzione di Poisson. Nell'output di BLAST compare infatti un valore P(N) che rappresenta la probabilità che il punteggio di tali HSP definisca una similarità casuale. Tanto più piccolo è questo valore, tanto maggiore è la probabilità che non si tratti di pura casualità.
Reference comments
3 hrs
Reference:
qui spiega cos'è
E' un libro quindi non si può fare copia incolla. Scrivi "smallest sum" nel campo ricerca e ti esce una frase che spiega il concetto.
http://books.google.it/books?id=kTOx-pYcBScC&pg=PA122&lpg=PA...
http://books.google.it/books?id=kTOx-pYcBScC&pg=PA122&lpg=PA...
Discussion
P(N) rappresenta la probabilità che il punteggio di tali HSP definisca una similarità casuale.
"... un allineamento locale il punteggio aumenta con il logaritmo del
prodotto delle lunghezze delle sequenze" from
http://schubert.bio.uniroma1.it/corsiol/docecorsi/BioinfoL3-... (slow site!)