De lo que se trata, en mi opinión, es de aunar esfuerzos en lugar de actuar de forma independiente

Agencias es un calco del inglés para referirse a organismos, órganos, dependencias, departamentos y en última instancia, agencias. Del mismo modo, esfuerzos se traduce por iniciativas, o acciones como bien sugiere Carmen.

Existe una diferencia semántica entre acción, iniciativa y esfuerzo. De acuerdo con el Diccionario de la Real Academia Española (definiciones pegadas a continuación), hacer un esfuerzo implica enfrentar dificultades y, a mi criterio, ese matiz no debe omitirse en la traducción.

Definiciones del DRAE:
- ACCIÓN: Ejercicio de la posibilidad de hacer; Resultado de hacer.
- INICIATIVA: Derecho de hacer una propuesta; acto de ejercerlo.
- ESFUERZO: Empleo enérgico del vigor o actividad del ánimo para conseguir algo venciendo dificultades.

Por otro lado, creo que "individuales" es la palabra que mejor queda en contraposición con el adjetivo "conjuntas" (evaluaciones conjuntas). Así queda bien marcado el antagonismo que el autor da a entender cuando usa la frase "rather than".

Finalmente, coincido en que "organismo" es la mejor traducción para "agency", salvo que se esté haciendo referencia a un área específica. Pego las definiciones del DRAE:
- AGENCIA: Organización administrativa especializada a la que se confía la gestión de un servicio.
- ORGANISMO: Conjunto de oficinas, dependencias o empleos que forman un cuerpo o institución.

¡Saludos!