Что такое "star sequence"? Это одна сторона шпильки (hairpin) или петли (loop) - структуры, которую временно приобретает микроРНК (до процессинга). Вторая сторона - это будущая зрелая миРНК (mature). В следующей ссылке они нарисованы. Зеленым цветом - "star sequence", красным - "mature"

http://genomebiology.com/2009/10/1/R6/figure/F2?highres=y

Можно сказать, что частично они комплементарны. Участки некомплементарности образуют "вздутия", нарушающие двухцепочечную структуру.

Откуда взялось слово "star" и что оно означает?
Я приведу два предложения, которые отвечают на этот вопрос. Оба они взяты из поисковика, сами ссылки, к сожалению либо не открываются, либо напрямую этих предложений (полностью) не содержат.

For ten miRNA hairpins, the mature miRNA and the corresponding miRNA star sequence (miRNA*, the small RNA from the opposite arm of the ...

The opposite strand, the so-called miRNA* (miRNA 'star') sequence, is thought to be degraded. In some cases, however, miRNA* sequences can ...

http://tinyurl.com/3yov2ng

Т.е., это просто звездочка, поставленная для отличения от "комплементарной" зрелой последовательности, которая потом уже участвует в тех взаимодействиях, относительно которых миРНК и пытаются использовать (регуляция экспрессии).

На русском вариантов типа "последовательность со звездочкой" я не нашел. Поэтому предлагаю более привычное название последовательность прим/штрих.