Interpreto que si vas navegando entre islas, la navegación se complica porque en los huecos entre islas se producen ráfagas de viento muy intensas y al pasar junto a ellas, se reducen al máximo. Yo lo experimenté navegando por las islas griegas y te da más de un susto. Seguramente hay un término más técnico para eso.

¡Suerte!

Not too sure it's what you need, as it means 'protected from the wind' rather than 'lack of wind', but decided to post it anyway, as you say it's a creative text.

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Note added at 2 hrs (2011-04-19 14:44:15 GMT)
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DRAE:

socaire.
(De or. inc.).
1. m. Mar. Abrigo o defensa que ofrece algo en su lado opuesto a aquel de donde sopla el viento.

Es común explicar la falta o ausencia de algo como una 'laguna'. Así, por ejemplo, las 'lagunas mentales'. Por lo tanto, el término puede aprovecharse metafóricamente en el caso de 'wind shadows' también. Igualmente se utiliza la expresión 'pozos de viento', pero no es tan clara para el receptor porque permite imaginarse más de un significado. 'Lagunas de viento', en cambio, no admite tanta ambigüedad.