Sep 2, 2017 15:53
7 yrs ago
7 viewers *
English term
Pan-сancer
English to Russian
Science
Biology (-tech,-chem,micro-)
In some instances, DNA methylation profiling assays are tailored to specific cancer types.
In some cases, DNA methylation profiling assays do not distinguish different cancer types under a ***pan-cancer setting***.
In additional instances, under low sample concentration conditions (e.g., in ng concentration condition), DNA methylation profiling assays lack reproducibility and have lowered sensitivity when compared to higher sample concentration conditions.
***
The top ten markers from each comparison were chosen for further validation analysis.
With 190 comparison groups, 10x190=1900 markers were chosen for future analysis.
After removing the duplicates, 958 unique markers were chosen for a ***pan-cancer panel*** which were tested in a validation cohort of 4000 tumor and 1000 normal tissues.
This panel was then used to survey plasma and body fluid samples from lung, breast, liver, and colorectal cancer patients and controls without cancer to validate its diagnostic and prognostic values.
Methylation patterns were correlated with expression gene expression profiles of markers in this panel.
In some cases, DNA methylation profiling assays do not distinguish different cancer types under a ***pan-cancer setting***.
In additional instances, under low sample concentration conditions (e.g., in ng concentration condition), DNA methylation profiling assays lack reproducibility and have lowered sensitivity when compared to higher sample concentration conditions.
***
The top ten markers from each comparison were chosen for further validation analysis.
With 190 comparison groups, 10x190=1900 markers were chosen for future analysis.
After removing the duplicates, 958 unique markers were chosen for a ***pan-cancer panel*** which were tested in a validation cohort of 4000 tumor and 1000 normal tissues.
This panel was then used to survey plasma and body fluid samples from lung, breast, liver, and colorectal cancer patients and controls without cancer to validate its diagnostic and prognostic values.
Methylation patterns were correlated with expression gene expression profiles of markers in this panel.
Proposed translations
12 mins
Selected
среди сотни разных форм/видов рака/онкологических (опухолевых) заболеваний)
Физиологическое старение сопровождается во многих тканях такими изменениями экспрессии ряда генов, которые никак нельзя объяснить накоплением мутаций [ Holliday, ea 1991 , Smith, J.R., ea, 1996 ]. Поскольку метилирование лежит в основе сайленсинга, то его участие как в обусловленных старением изменениях транскрипции, так и в возникновении опухолей предполагалось давно [ Vanyushin, ea 1973 , Ванюшин ea 1977 , Holliday, ea 1987 ].
http://humbio.ru/humbio/methilation/000200ca.htm
Важными этапами в развитии злокачественных новообразований является предварительное гипометилирование ДНК[10] и последующая инактивация генов-супрессоров опухолевого роста[11]. В случае, когда инактивация была обусловлена метилированием промоторной области гена, проводились эксперименты по возобновлению экспрессии путём ингибирования DNMT.
https://ru.wikipedia.org/wiki/Метилирование_ДНК
https://health.mail.ru/news/uchenye_sostavlyayut_bespretsede...
Публикации - Онкология и гематология - страница 5 - MedNovelty.ru
mednovelty.ru/content/oncology_and_haematology/page-5/ -
Это определяет некоторые особенности заболевания. ... быть прекрасным средством профилактики для всех видов онкологических заболеваний. .... Создатели проекта, названного Pan-Cancer Initiative и начатого в 2012 году, ...
--------------------------------------------------
Note added at 13 mins (2017-09-02 16:07:46 GMT)
--------------------------------------------------
1. не различают разные типы среди сотни разных видов рака
2. не различают разные типы рака среди сотни разных форм онкологических (опухолевых) заболеваний
--------------------------------------------------
Note added at 16 mins (2017-09-02 16:09:50 GMT)
--------------------------------------------------
Abstract
Cancer can take hundreds of different forms depending on the location, cell of origin and spectrum of genomic alterations that promote oncogenesis and affect therapeutic response. Although many genomic events with direct phenotypic impact have been identified, much of the complex molecular landscape remains incompletely charted for most cancer lineages. For that reason, The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has profiled and analyzed large numbers of human tumours to discover molecular aberrations at the DNA, RNA, protein, and epigenetic levels. The resulting rich data provide a major opportunity to develop an integrated picture of commonalities, differences, and emergent themes across tumour lineages. The Pan-Cancer initiative compares the first twelve tumour types profiled by TCGA. Analysis of the molecular aberrations and their functional roles across tumour types will teach us how to extend therapies effective in one cancer type to others with a similar genomic profile.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3919969/
http://humbio.ru/humbio/methilation/000200ca.htm
Важными этапами в развитии злокачественных новообразований является предварительное гипометилирование ДНК[10] и последующая инактивация генов-супрессоров опухолевого роста[11]. В случае, когда инактивация была обусловлена метилированием промоторной области гена, проводились эксперименты по возобновлению экспрессии путём ингибирования DNMT.
https://ru.wikipedia.org/wiki/Метилирование_ДНК
https://health.mail.ru/news/uchenye_sostavlyayut_bespretsede...
Публикации - Онкология и гематология - страница 5 - MedNovelty.ru
mednovelty.ru/content/oncology_and_haematology/page-5/ -
Это определяет некоторые особенности заболевания. ... быть прекрасным средством профилактики для всех видов онкологических заболеваний. .... Создатели проекта, названного Pan-Cancer Initiative и начатого в 2012 году, ...
--------------------------------------------------
Note added at 13 mins (2017-09-02 16:07:46 GMT)
--------------------------------------------------
1. не различают разные типы среди сотни разных видов рака
2. не различают разные типы рака среди сотни разных форм онкологических (опухолевых) заболеваний
--------------------------------------------------
Note added at 16 mins (2017-09-02 16:09:50 GMT)
--------------------------------------------------
Abstract
Cancer can take hundreds of different forms depending on the location, cell of origin and spectrum of genomic alterations that promote oncogenesis and affect therapeutic response. Although many genomic events with direct phenotypic impact have been identified, much of the complex molecular landscape remains incompletely charted for most cancer lineages. For that reason, The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has profiled and analyzed large numbers of human tumours to discover molecular aberrations at the DNA, RNA, protein, and epigenetic levels. The resulting rich data provide a major opportunity to develop an integrated picture of commonalities, differences, and emergent themes across tumour lineages. The Pan-Cancer initiative compares the first twelve tumour types profiled by TCGA. Analysis of the molecular aberrations and their functional roles across tumour types will teach us how to extend therapies effective in one cancer type to others with a similar genomic profile.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3919969/
Note from asker:
Я pan-cancer panel и переводил примерно как "общую панель для определения формы рака", но сочетания pan-cancer setting и panCancer Meth меня слегка сбивают с толку. В принципе, это могут быть "условия проведения общего анализа на определение формы рака" и "степень метилирования среди различных форм рака", но я сомневаюсь, мне там числовые значения в графиках (см. обсуждение в панели) не понятны. |
4 KudoZ points awarded for this answer.
20 mins
универсальная онкологическая тест-система
или более длинно:
универсальная тест-система для диагностики разных видов рака
Приблизительно вот как здесь:
https://gynendo.ru/novyj-test-v-krovi-opredelyaet-i-klassi/
А в принципе есть уже даже такой коммерческий набор:
http://tinyurl.com/yddcclbt
(хотя, судя по описанию, это не ваш случай)
универсальная тест-система для диагностики разных видов рака
Приблизительно вот как здесь:
https://gynendo.ru/novyj-test-v-krovi-opredelyaet-i-klassi/
А в принципе есть уже даже такой коммерческий набор:
http://tinyurl.com/yddcclbt
(хотя, судя по описанию, это не ваш случай)
Note from asker:
Меня там больше случай с фигурами озадачил. В панели обсуждения привел ссылку. |
1 hr
любые виды рака
Некоторые системы для анализа метилирования ДНК адаптированы для отдельных видов рака.
Другие системы для анализа метилирования ДНК не различают отдельные виды рака в режиме "любые виды рака".
..система для анализа любых видов рака включает 958 уникальных маркеров и прошла испытания...
На графике "pan cancer meth" под осью абсцисс = метилирование ДНК (режим " любые виды рака")
Другие системы для анализа метилирования ДНК не различают отдельные виды рака в режиме "любые виды рака".
..система для анализа любых видов рака включает 958 уникальных маркеров и прошла испытания...
На графике "pan cancer meth" под осью абсцисс = метилирование ДНК (режим " любые виды рака")
Peer comment(s):
neutral |
Natalie
: Слово "режим" здесь совершенно неуместно: это же не прибор, в котором можно взять и выставить режим измерения чего-то
2 hrs
|
Discussion
Кстати, термин "пан-раковый" вполне можно использовать (он уже и так используется)
Или можно в базе заявок перейти к исходному документу http://tinyurl.com/y8m6o6ev и там на 460 странице, например, и далее глянуть.