Bez kontekstu tylko mogę zgadywać.

W księgowości "interco"(mpany) to często obroty pomiędzy podmiotem nadrzędnym a zależnym (tylko w takiej sytuacji w jednym miejscu masz dane z "obydwu stron" transakcji).

Może chodzić albo o to, że obroty są przypisane do niewłaściwych podmiotów, albo (to bym obstawiał) że transakcja zaksięgowana jest z inną wartością w księgach podmiotu nadrzędnego i zależnego.